3 этаж: Библиотека
Согласно историческим источникам в 1623 году канцлер Мартин фон Валленродт основал свою личную библиотеку. Канцлер был весьма просвещенным человеком, любил книги и собирал их всю жизнь. Создал великолепную библиотеку, состоявшую более чем из трех тысяч томов. К сожалению, это собрание сгорело вместе с домом канцлера. Вскоре канцлер начал собирать новую библиотеку и вновь создал неплохое собрание книг и манускриптов, около 2000 единиц. Сын канцлера значительно расширил собрание книг, присоединив к нему коллекцию монет, картин, скульптур и антиквариата. В 1650 г сын канцлера фон Валленродта, подарившего городу свою библиотеку, приобрел «бесполезное и беспризорное помещение в Кнайпхофской церкви, вверху близ органа, подле колокольни»,чтобы поместить там библиотеку к «благу учащейся молодежи». По-видимому в Европе это был первый случай, кода светская библиотека располагалась в храме. В переходе между двумя помещениями находилась скульптура женщины, как олицетворение мудрости. У входа в библиотеку висели правила посещения. Например: «Тот, кто намеревается войти, пусть очистит обувь от грязи, стряхнет пыль или дождевую воду с одежды»; «Ножницами или ножом книги пусть не режет и не пачкает их». Семья Валленродтов следила за состоянием библиотеки, щедро выделяя деньги на пополнение книжного фонда, его содержание и обслуживание. 
Судьба собрания книг была юридически определена заранее. Никто не имел права делить коллекцию, изымать из нее экземпляры! Надзор за делами в библиотеке осуществлялся старшим членом семьи Валленродтов. Специально оговаривалось, что библиотекарем может быть только профессор или ученый университета Альбертина. К 1944 году библиотека начитывала более 20 тысяч единиц хранения. Во время пожара 30 августа 1944 года часть книг была эвакуирована на юг Восточной Пруссии.
В 1981 году тома Валленродтской библиотеки были обнаружены в хранилищах "трофейных книг" в усадьбе Узкое под Москвой и переданы Калининградскому государственному университету. 291 переплет из Валленродтского собрания ныне хранится в библиотеке Калининградского университета. Книги из Валленродтской библиотеки встречаются сейчас в хранилищах Польши, Литвы, Москвы, Петербурга и Калининградской области. 
К 750-летию Калининграда мебельная фирма «Максик», по заказу Кафедрального собора, выполнила реконструкцию Валленродтской библиотеки. Реконструкция была выполнена по документальным фотографиям мастерами - резчиками по дереву. Витраж «Герб Валленродтов» был выполнен калининградскими мастерами, и в точности повторяет тот витраж, который был здесь когда-то. Основатели библиотеки отец и сын Валленродты удостоились посмертной чести быть погребенными в самом почетном месте упокоения - в усыпальнице Кафедрального собора. На внутренней стороне южной стены храма места их погребения были отмечены надгробными таблицами.